这要看配偶不能申请移民的理由是什么。如有合理的理由不能一起随行，是可以的。

如果是有较严重的问题，就可能影响申请。因为家庭成员无论是否随同申请，应提交的资料和参与程式都是一样的，所以配偶不随同一起申请，但问题仍然存在。